Прямые микроскопы
Прямые микроскопы применяются для работы с предметными стеклами. Для исследования гистологических, цитологических препаратов. ИГХ, флуоресценции. Прямые микроскопы могут быть оснащены следующими методиками контрастирования – светлое поле, темное поле в проходящем свете, фазовый контраст, поляризация и флуоресценция. В зависимости от типа системы доступны различные объективы. Камера на прямые микроскопы устанавливается на тринокулярный тубус.
Инвертированные микроскопы для медицины и биологии
Применяются для исследования клеток и клеточных колоний в чашках Петри, многолуночных планшетах.
На базе инвертированного микроскопа строятся системы ЭКО. Для этого на микроскопы устанавливаются микроманипуляторы и лазер.
Инвертированный микроскоп для биологии может поддерживать следующие методики контрастирования: проходящий свет светлое поле, флуоресценцию. Очень часто фазовый контраст или рельефный контраст, если работа ведется с живыми клетками.
Стереомикроскопы
Применяются для исследования объектов в чашках Петри при высеивании микробной культуры. Также часто применяются в лабораториях ЭКО для предварительного отбора материала. В биологических исследованиях целесообразно устанавливать на стереомикроскоп осветитель проходящего света с зеркалом, либо возможностью косопадающего освещения. Для визуализации гидробиологии, простейших, нематод, одноклеточных нужно использовать проходящий косопадающий свет.

